国立晋州博物馆位于晋州城内。该馆于1984年开馆，后于1998年被改建成“壬辰倭乱”专门博物馆。比起地方特色来，该馆的各个展厅主要是围绕“壬辰倭乱”这个主题而建的。晋州是当年“壬辰倭乱”时期和倭寇进行晋州决战的地方，因而留下了以矗石楼为代表的许多有关“壬辰倭乱”的历史遗物。

在国立晋州博物馆一层，可以观赏到和“壬辰倭乱”有关的文学著作、绘画音乐作品等，在这里可以通过当时俘虏们的生前记载和西方人的视角纵观“壬辰倭乱”的全貌。所有的展品都是以不同的主题为单位而进行展示的。这里的展品是分别来自韩国和日本出土的有关“壬辰倭乱”的遗物，透过它们可以清楚地了解“壬辰倭乱”的情况。从里面走出来，还可以看到“壬辰倭乱”中重要事件的图片文字说明。这里还有一个叫“斗庵室”的展厅，它是为纪念向该博物馆捐赠179件文物的斗庵先生而命名的，其中主要展示了绘画作品、陶瓷器、工艺品等。在二层的展厅里可以亲身体验到“壬辰倭乱”的全过程，各种文物都是按照时间的顺序而布局，还分成义兵、武器等主题进行展示。

该展厅以“壬辰倭乱”的爆发为起端，一直到留有李顺臣将军遗言的《李忠武*》全书展示场为结尾而设置的。在这里可以看到当年韩国守军用以抗击倭寇发明制造的具有代表意义的舰船——乌龟战船的大型模型。