黄大仙祖宫呈七迸阶布局，从南向北依次为石照壁，石牌楼， 灵官殿，钟楼、祭坛、鼓楼，大殿，三清殿，祈仙殿等。南面 五进现已完工，石照壁长18米，厚1．5米，高4．8米，气势磅 礴。照壁南面刻有黄大仙金华山牧羊及大仙兄弟两人骑鹿驾鹤得道升天传说的浮雕，照壁北面刻着金华著名书法家毕民望老先生手书篆体赤松仙师自序。照壁对面的石牌楼（三重檐的主牌楼，两重檐的两座边牌楼）全部用石板砌成，结构精巧，错落有致，体现了道观建筑庄重的宗教氛围。 祭坛是祖宫内宗教法事活动的主要场所。祭坛还有个非常神秘有趣的现象，每当游客站到坛中央鱼形太极图的中心喊一声，就能听到四面传来较大的回音，人犹如站在谷底。祭坛东西两面的钟楼和鼓楼，为四重檐结构，层层叠叠，别开生面，富有道教特色。其内的铜钟重3吨，木鼓直径1．5米。

大殿为道教典型的歇山顶重檐结构，占地1068平方米，总高20.88米，气势宏伟，再现了当年江南道观之冠的雄姿。殿内的黄大仙神像座坛高1．668米，像高5米，整个神像由香樟精心雕刻彩绘而成，散发出阵阵清香。神像坐姿神态安详。自然、传神，体现了东阳木雕传统工艺之绝之妙。大殿左右两壁仿青铜的根木浮雕展现了1700年前流传至今并不断创新的有关黄大升仙的传说，从出生到得道成仙再到香港显灵，分别为“玉帝赐胎，初平牧羊、叱石成羊、赠桃度仙、大仙行道”等乃个故事。刻工情细拼卜实，人物栩栩如生，整个浮雕古色古香，清幽素雅，别有一番韵味。