殿内中央供奉的是“玉皇大帝”，左为“天皇大帝”和“南极长生大帝”，右为“紫微大帝”及“后土皇地祗”。两侧为年、月、日、时四值功曹。道经上说：天有三十六层，三清居上三层。玉帝居三十三天为万夫之主，主宰人间天上的祸福吉凶，及世界兵革、劫运，是民间信仰的高神灵。左、右四位大帝，分别统帅万星、万雷、万灵、万地，以辅佐玉皇。传说四值功曹体察人间善恶功过，时记月累，年满上奏玉帝。腊月廿五玉帝下界巡世， 以人们所做的善恶或赐福或降恶。这天古代皇帝都要举行盛大的祭天活动，以求国泰民安，天下太平。灵霄殿的两壁画的是“太乙救苦天尊”和“玄天上帝”带领各自部下神将朝拜玉帝，奏事请旨的场面。画中人物栩栩如生，神态端庄各异，体现了天界的庄严和诸神的无边法力。当年唐玄宗为感谢玉皇大帝的点化、护佑之恩，命人在这里修建了灵霄殿以及九曜星君殿和六丁六甲殿。