主要建筑有庙门、诚心亭、碑亭和人文初祖殿。庙院内主要的建筑是"人文初祖"殿，初建于明朝，后代屡有修缮,人文初祖殿占地282平方米，面阔七间，进深三间。门额上悬挂着程潜先生于1938年祭陵时所题写的"人文初祖"四个大字。庙院西邻为保生宫旧址，现状有由黄陵县文庙迁建的古建筑两座。目前是黄陵文管所驻地.庙院内主要的建筑是“人文初祖”殿，初建于明朝，后代屡有修缮。轩辕庙总占地面积26亩。主要建筑沿南北轴线顺次排列为庙门、诚心亭、碑亭和人文初祖大殿，东侧为碑廊，西侧为接待室和文物展室其风格多为明代歇山形建筑。庙内共存放古今石碑五十余通。这些石碑有北宋以来的“御制祝 文”、名人题咏和重修碑记，包括孙中山、将中正、毛泽东的诗文、题字和祭文。由江泽民、李鹏为黄帝陵整修工程的题词以及董建华亲笔题写的“香港回归纪念碑”也赫然立于庙内，给这座千年古庙增添了时代气息.