吴江慈云禅寺创建于宋咸淳（公元1265—1274年）年间。明正统中（1436—1449年）重建，旧名广济寺。明顺年间（1457—1464年）赐今额。中有浮屠五级，相传三国赤乌13年（250年）初建，明万历五年（1577年）寺与塔均重建。自明万历至汪康熙、乾垄道光历朝多次增建殿宇堂轩，成为吴江市（县）内规模较大的佛教寺院，历代高僧辈出，明有道泽、慈林，清有净眼、超伟法师及断手誓修天王殿的化主天衣僧。古刹名寺历来文人游踪不绝，留下诗篇甚多。清金圣叹留别诗：“震泽多精舍，慈云师子林。家私唯古佛，眷属总玄心。后汉人何在？微言乃至今，相逢随欲别，舍此更何寻？”清咸丰十年（1860年）寺毁于兵燹，唯塔独存。