水生生物馆包括演化厅、淡水厅和海水厅。 观众在这里可以学习鱼类起源和演化的相关知识，观察水生生物的生活情况，了解其生活习性以及行为特点。 展厅中展出了许多非常珍贵的鱼类标本，比如对研究水生生物登陆具有重要意义的拉蒂迈鱼、饱经沧桑的肺鱼、长江中的中华瑰宝―中华鲟等等。这里还展出了100多种水生生物，其中热带观赏鱼包括淡水鱼和海水鱼，它们或色彩艳丽，或体形怪异，或生活习性奇特，可谓琳琅满目，令人赏心悦目；还有爬行类的海龟、两栖类的泥螈、无脊椎动物中的海葵和珊瑚等等。