三清阁，在太华山南面罗汉山，距太华寺两公里，罗汉山北连美女峰、太华峰，南接挂榜山千仞峭壁，峭壁下是浩瀚滇池。三清阁九层十一阁建筑群高低错落，建筑在罗汉山与挂榜山之间的悬崖绝壁上，它高出滇池水面三百多米，置身于此，有"海市蜃楼"、 "空中楼阁"之感。

明宣德年间，沐氏捐资，无边禅师重建。明正德年间，了纯和尚在此结庵卓锡，称海涯寺，一名妙定寺。摆渡村民李应举捐资扩建海涯寺，建弥勒殿。因峭壁半空悬石如罗汉，海涯寺又称罗汉寺。明嘉靖年间，罗汉寺倾圮，道士赵炼在罗汉山辟道观。明末，徐霞客《游太华山记》详细记载了罗汉寺南北庵的盛况：北庵有灵官殿、纯阳楼、玄帝殿、玉皇阁、抱一宫，"皆东向临海，嵌悬崖间。"清乾隆55年(1790年)，道士杨来祥、何来昆募缘增修，改称"玉皇阁"。清道光年间，重修灵官殿、玉皇阁，增建斗母殿、太清宫。清至民国年间，三清阁屡次修葺，均保持了原有的道观建筑风格。1966年"扫四旧"期间，三清阁个殿阁内的神像，多数被捣毁，至今仅存灵光殿王灵官及侍从塑像。1972年以后，清阁各殿宇均进行过维修。1984年新凿罗汉崖回车隧道。1999年又新修了三百多米的三清阁迂回游步道。