祗园寺是九华山四大丛林之一，位于九华街入口处，为全国重点寺院，又名祗园禅寺，古名祗园、祗树庵。初建于明代嘉靖年间，清代多次重修和增建。“祗园”本是印度佛教圣地，相传释迦牟尼在祗园宣扬佛教二十余年。九华山祗园寺即根据这个故事而建，故名。祗园寺是九华山早的宫殿式寺庙，也是山上的一座宫殿式建筑，规模为全山寺院之冠。寺依山而建，层层叠叠，鳞次节比，飞檐画栋，金碧辉煌，有大雄宝殿、方丈寥、退居寥、衣钵寥、大寮、小寮、客厅等上百间房屋。但整个建筑并非对称，而是曲曲折折。步入寺门是灵官殿，过一小庭院，一方形重檐殿堂是天王殿，从殿后小院上石阶十余步，便到大雄宝殿。大雄宝殿殿内宝气凝聚，煜然炫灿。从大殿对面的回廊前进，有法堂、斋堂，楼下有禅堂、新戒堂等殿堂。寺内有铜质大锅一口，名“千僧锅”。1933年开办“五百罗汉期”的授戒*，就用它煮饭，供应千人斋饭。这大概是九华山规模大的“大锅饭”了。由此可见祗园寺规模之大。不过，寺内佛像倒是很整齐，一进门厅是哼哈二将，二进是四大金刚、弥陀佛。大雄宝殿从平地至殿顶号称十三丈高，殿门檐上横悬着书法家于右任先生书写的“大雄宝殿”金字大匾。殿正中莲花台上端坐着三尊二丈多高的贴金大佛：中坐者为“如来”，左边一尊为“阿弥陀佛”，右边一尊为“药师佛”。此三尊大佛均为九华山寺庙佛像之冠。祗园寺东侧是藏经楼、上客堂。藏经楼内珍藏稀珍经书。其中《龙藏》，全称《乾隆版大藏经》，又名《清藏》，完成于清高宗乾隆三年（公元1738年），是清代的官刻汉文大藏经，全藏共收经1669部、7168卷，弥足珍贵。